Procomcure offre des services complets d’analyse du microbiome à l’aide du séquençage de nouvelle génération (NGS) pour fournir une vue complète et détaillée de la composition, de la diversité et de la fonction des communautés microbiennes. Nos services sont adaptés à divers domaines de recherche, notamment la santé humaine, animale et environnementale, ainsi que l’industrie alimentaire et agricole.

Services spécifiques :

Nous proposons un flux de travail complet pour l’analyse du microbiome, y compris :

• Extraction d’ADN : C’est implicite, mais nous le proposons également en tant que service autonome.
• Préparation des bibliothèques : Adaptation de l’ADN pour le séquençage NGS.
• Séquençage NGS : Séquençage parallèle massif pour obtenir des lectures d’ADN microbien.
• Analyse bioinformatique :
  • Identification et quantification des taxons : Nous déterminons la composition taxonomique du microbiome, en identifiant et en quantifiant les différentes bactéries, archées, champignons et virus présents.
  • Analyse de la diversité alpha et bêta : Nous évaluons la diversité microbienne au sein d’un échantillon (alpha) et entre différents échantillons (bêta), fournissant des informations sur la richesse et l’uniformité des communautés.
  • Analyse fonctionnelle : Prédiction des fonctions métaboliques et des voies présentes dans le microbiome, permettant de comprendre leur impact sur l’hôte ou l’environnement.
  • Analyse phylogénétique : Reconstitution des relations évolutives entre les différentes espèces microbiennes.
  • Analyse des biomarqueurs : Identification de micro-organismes ou de gènes associés à des conditions spécifiques.

Nos services d’analyse du microbiome sont applicables à un large éventail d’études :

• Santé humaine : Recherche sur la relation entre le microbiome et diverses maladies, telles que les maladies inflammatoires de l’intestin, l’obésité, le diabète, les maladies cardiovasculaires et les troubles neurologiques.
• Santé animale: Études sur le microbiome animal et son influence sur la santé, la productivité et la résistance aux maladies.
• Santé environnementale : Analyse du microbiome dans différents écosystèmes, tels que le sol, l’eau et l’air, pour comprendre son rôle dans les cycles biogéochimiques et la bioremédiation.
• Industrie alimentaire et agricole : Caractérisation du microbiome dans les aliments et les cultures afin d’améliorer la sécurité alimentaire, la qualité des produits et la productivité agricole.

• Test du microbiome intestinal : L’analyse du microbiome intestinal permet aux individus de mieux comprendre leur propre microbiote intestinal. Ce test peut fournir des informations sur les déséquilibres du microbiote intestinal (dysbiose) et leur relation possible avec la santé digestive et le bien-être général.
• Test de microbiome capillaire :Votre cuir chevelu abrite un écosystème complexe et dynamique de milliards de micro-organismes connus sous le nom de microbiome capillaire. Ce microbiome joue un rôle crucial dans la santé et l’apparence de vos cheveux. Un bon équilibre des bactéries sur le cuir chevelu est essentiel pour des cheveux brillants et forts et un cuir chevelu sain.
• Test du microbiome féminin :Le vagin est un organe complexe qui abrite un écosystème dynamique de micro-organismes, principalement des bactéries, connu sous le nom de microbiome vaginal. Ce microbiome joue un rôle fondamental dans la santé intime des femmes, influençant des aspects aussi importants que la prévention des infections, la fertilité et le bien-être général.
• Test du microbiome buccal : Le microbiome buccal, la communauté complexe de micro-organismes qui habitent notre bouche, joue un rôle crucial dans notre santé, tant buccale que générale. Nos habitudes de vie influencent directement cet écosystème délicat.
• Test de microbiome cutanéVotre peau abrite un écosystème complexe de milliards de micro-organismes, connu sous le nom de microbiopeau. Ce microbiome joue un rôle essentiel dans la santé et l’apparence de votre peau.

Procomcure propose une large gamme de consommables et de réactifs de haute qualité conçus pour optimiser les flux de travail en biologie moléculaire et garantir la qualité et la reproductibilité des résultats expérimentaux. Son catalogue comprend :

• Consommables PCR : Procomcure propose une variété de consommables PCR pour répondre aux différents besoins et formats des laboratoires :
  • Plaques PCR : Disponible en formats 96 et 384 puits, avec différentes options de bords (avec ou sans bordure) et de couleurs. Fabriqué en polypropylène de haute qualité pour un transfert de chaleur efficace et une faible liaison ADN/ARN.
  • Plaques à puits profonds : Idéal pour le stockage et la manipulation de grands volumes d’échantillons. Disponible en différentes capacités et formats.
  • Tubes PCR : Tubes individuels et bandes de tubes avec bouchons individuels ou en bandes. Disponible en différents volumes et avec différentes options de couvercle (plat ou bombé).
  • Joints de plaque : Joints adhésifs et scellés thermoscellables pour éviter l’évaporation et la contamination croisée lors de la PCR.

Ces consommables sont compatibles avec les réactifs PCR Procomcure et sont utilisés dans diverses applications, notamment la préparation de bibliothèques pour le séquençage NGS et la réalisation de PCR pour la détection d’agents pathogènes ou le génotypage.

• Kits d’isolement d’ADN/ARN : Procomcure propose des kits pour l’extraction efficace et rapide d’ADN et d’ARN à partir d’une grande variété de types d’échantillons, notamment :
  • Kits d’ADN génomique : Pour l’extraction d’ADN de haute qualité à partir de sang, de tissus, de cellules, de salive et d’autres types d’échantillons.
  • Kits d’ARN total : Pour l’extraction de l’ARN total, y compris l’ARN messager (ARNm), l’ARN ribosomique (ARNr) et les petits ARN.
  • Kits d’ADN/ARN viral : Pour l’extraction d’acides nucléiques viraux à partir de différents types d’échantillons.
  • Kits FFPE : Kits optimisés pour l’extraction d’ADN et d’ARN à partir d’échantillons fixés au formol et inclus dans de la paraffine.

La haute qualité de l’ADN et de l’ARN extraits à l’aide de ces kits est cruciale pour le succès des applications en aval telles que le séquençage NGS (WGS, WES, RNA-Seq, séquençage ciblé et métagénomique) et la PCR. Procomcure propose des kits optimisés pour différents types d’échantillons, garantissant l’obtention d’acides nucléiques de haute pureté et à haut rendement, ce qui est essentiel pour des résultats fiables dans les services de séquençage et d’analyse bioinformatique.

• Réactifs PCR : Procomcure propose une gamme complète de réactifs PCR, notamment :
  • ADN polymérases : Polymérases haute fidélité, polymérases à démarrage à chaud et polymérases PCR standard. Optimisé pour différentes applications, telles que la PCR haute fidélité, la PCR multiplex et la RT-PCR.
  • Mixages principaux : Des mélanges prêts à l’emploi qui contiennent tous les composants nécessaires à la PCR, y compris la polymérase, les dNTP, le tampon et les ions magnésium. Disponible en différentes formulations pour s’adapter à différentes applications.
  • Les dNTP : Désoxynucléotide triphosphate de haute qualité.
  • Tampons PCR : Tampons optimisés pour différentes applications PCR.
  • Additifs PCR : Additifs qui améliorent les performances de la PCR dans des conditions difficiles, telles que la présence d’inhibiteurs.

Ces réactifs sont essentiels pour une variété d’applications, notamment :

• Préparation des bibliothèques pour le séquençage NGS : Les polymérases haute fidélité de Procomcure sont idéales pour amplifier les bibliothèques de séquençage, garantissant une haute fidélité et un faible taux d’erreur.
• Validation des résultats de séquençage : La PCR est souvent utilisée pour valider les variants génétiques identifiés par séquençage NGS.
• Détection d’agents pathogènes : Les kits PCR et les réactifs Procomcure peuvent être utilisés pour la détection rapide et sensible des agents pathogènes, en complément des services de métagénomique.
• Analyse de l’expression génique par RT-PCR : La RT-PCR est utilisée pour quantifier l’expression des gènes, en complément des données obtenues par RNA-Seq.

La capacité de Procomcure à surmonter les inhibiteurs de la PCR, comme mentionné dans l’un des résultats de recherche (« Kit de résolution de problèmes PCR pour les fabricants de kits de test PCR et de diagnostic moléculaire (MDx), hautement résistant à un large éventail d’inhibiteurs de la PCR tels que l’héparine (échantillons de sang), le sérum ou l’acide humique (échantillons de sol / de plantes) »)¹ , est une valeur ajoutée importante qui profite aux clients travaillant avec des échantillons complexes.

• Kits de prélèvement d’échantillons : Procomcure propose des kits pour la collecte et le transport sûrs et pratiques d’échantillons biologiques :
  • Kits d’écouvillons : Pour le prélèvement d’échantillons de muqueuse buccale, nasale ou pharyngée.
  • Kits salivaires : Pour le prélèvement non invasif d’échantillons de salive.
  • Exemples de kits de transport : Pour le transport en toute sécurité d’échantillons à température ambiante ou réfrigérés.

La collecte et le transport appropriés des échantillons sont essentiels à la qualité des résultats dans toutes les applications de biologie moléculaire, y compris le séquençage NGS, l’analyse du microbiome et la PCR. Les kits Procomcure garantissent l’intégrité de l’échantillon et minimisent le risque de contamination.

Accent mis sur la qualité et l’optimisation (avec connexion à d’autres services) :

Tous les consommables et réactifs Procomcure sont fabriqués dans le cadre de contrôles de qualité stricts afin de garantir la reproductibilité et la fiabilité des résultats. De plus, ils offrent un support technique pour aider les clients à sélectionner les produits les plus adaptés à leurs besoins spécifiques et à optimiser leurs protocoles expérimentaux, qu’il s’agisse de préparer des échantillons pour le séquençage, d’effectuer des PCR de validation ou d’effectuer des analyses de microbiome.

En plus des réactifs et des consommables, Procomcure propose une gamme d’équipements d’analyse qui complètent ses services de séquençage et de PCR, permettant aux laboratoires d’effectuer des tests et des analyses de diagnostic de manière efficace et précise. En voici quelques exemples qui renforcent le lien avec d’autres services :

• Équipement de diagnostic moléculaire (exemples) : Procomcure propose également des équipements pour une variété d’autres applications de diagnostic moléculaire, notamment :
  • Thermocycleurs conventionnels : Pour des performances PCR standard, qui peuvent être utilisées en combinaison avec les réactifs PCR Procomcure pour diverses applications, telles que la validation des résultats de séquençage ou la détection d’agents pathogènes.
  • Systèmes d’électrophorèse capillaire : Pour l’analyse de fragments d’ADN et d’ARN, qui peuvent être utilisés pour confirmer les résultats obtenus par PCR ou séquençage.
  • Lecteurs de microplaques : Pour la lecture de plaques ELISA et d’autres tests immunologiques, qui peuvent compléter l’analyse génétique en offrant une vue plus complète de l’état du patient.
  • Équipement pour le test de lactose (et autres intolérances alimentaires) : Procomcure fournit des solutions complètes pour la détection de l’intolérance au lactose et d’autres intolérances alimentaires grâce à l’analyse génétique. Kits de génotypage : Kits spécifiques pour la détection de variants génétiques associés à l’intolérance au lactose (tels que le variant C >T LCT-13910). Ces kits sont basés sur des technologies telles que la PCR en temps réel ou la PCR à discrimination allélique et sont complétés par les réactifs PCR de Procomcure, assurant l’optimisation de la réaction.

Cette approche permet un diagnostic génétique précis de l’intolérance au lactose, en différenciant l’hypolactasie primaire de l’adulte (la forme la plus courante d’intolérance au lactose) et les autres causes de malabsorption du lactose.

Ce service est complété par le conseil technique de Procomcure pour l’interprétation des résultats et la conception d’études de recherche.

• Équipement PCR en temps réel : Thermocycleurs PCR en temps réel qui permettent l’amplification et la quantification de l’ADN en temps réel, facilitant ainsi la détection rapide et précise des variantes génétiques. Ces kits sont essentiels pour les tests de lactose et autres tests génétiques, et s’intègrent parfaitement aux kits d’extraction d’ADN Procomcure pour un flux de travail complet de l’échantillon au résultat.
• Logiciel d’analyse : Logiciel spécialisé pour l’analyse des données PCR en temps réel, permettant l’interprétation des résultats et la création de rapports. Ce logiciel peut même être intégré aux plateformes bioinformatiques Procomcure pour une analyse plus approfondie et des rapports personnalisés.

L’offre d’équipements peut inclure des solutions pour :

• Détection d’agents pathogènes : Des équipements et des kits pour la détection de bactéries, virus et autres micro-organismes, qui sont complétés par les services de métagénomique de Proprocure pour l’identification et la caractérisation de communautés microbiennes complexes.
• Diagnostic des maladies génétiques : Équipements et kits pour la détection des mutations associées aux maladies génétiques, qui sont intégrés aux services de séquençage (WES, séquençage ciblé) pour une analyse plus complète et l’identification de nouveaux variants.
• Oncologie moléculaire : Équipements et kits pour l’analyse de marqueurs tumoraux et la détection de mutations somatiques dans le cancer, qui sont complétés par des services de séquençage de l’exome entier et de séquençage ciblé pour l’identification des variants pertinents en oncologie.

• Intégration avec les services Procomcure : L’équipement d’analyse proposé par Procomcure est conçu pour s’intégrer à vos autres services, créant ainsi un flux de travail sans faille, de la préparation des échantillons à l’analyse des données.
  • Extraction – PCR – Analyse : Par exemple, un laboratoire pourrait utiliser un kit d’extraction d’ADN/ARN Procomcure, effectuer une PCR avec les réactifs Procomcure dans un thermocycleur fourni par Procomcure, puis analyser les résultats avec le logiciel d’analyse Procomcure. Ce flux de travail intégré minimise les erreurs, fait gagner du temps et assure la compatibilité entre les différents composants.
  • Séquençage – Validation : Les résultats obtenus par séquençage NGS peuvent être validés par PCR à l’aide de l’équipement et des réactifs Procomcure.
  • Métagénomique – Analyse fonctionnelle : Les données obtenues grâce à la métagénomique peuvent être complétées par des analyses fonctionnelles à l’aide d’équipements et de kits spécifiques.